700年前灌木恐鸟完整基因组被重组，“侏罗纪公园”或非幻想 _小知识

迄今为止，地球已经履历了五次物种年夜灭尽。而今，很多专家警告说，第六次物种年夜灭尽已经到来，人类就是祸首祸首。仅仅在 17 宿世纪到 20 宿世纪末的短短 300 年里，单是动物，已有 300 多种永远离我们而去，包罗渡渡鸟，年夜海雀等。令人切齿痛恨的是，据统计，在将来 50 年中，地球陆地上四分之一的动物和植物如帝企鹅，中华鲟等都将遭到没顶之灾。
日益严重的生物多样性问题已经起头危及人类保存自己，科学家们也一向在测验考试若何减缓这一过程，此中就包罗测验考试新生灭尽物种。

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图 | 帝企鹅
近日，来自哈佛年夜学的科学家们用现代手艺当作功初次完整重组灭尽了 700 年的小灌木恐鸟基因组，这使得绝迹基因组学标的目的实现 De-extinction （新生灭尽物种）方针——重现绝迹物种——更进了一步。

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图 | 年夜灌木恐鸟
灌木恐鸟附属于始鸟下纲，近亲有鹬鸵，鸵鸟和鸸鹋，它按照大小被分为九种，但此刻全数都已灭尽。此中，小灌木恐鸟是该物种最小和最常见的变种，平均身高约 4 英尺，体重约 66 磅，以植物为食。
按照新西兰导报（the NZ Herald），它们原师长教师活在新西兰海说神聊岛和南岛的丛林中，但在公元 14 宿世纪后期，因波利尼西亚人的过度捕猎，灌木恐鸟灭尽了。

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图 | 分歧种类的灌木恐鸟
此研究固然今朝只在线上展示了非同业评断，正式论文尚未颁发，但在绝迹基因组范畴中已经颤动不凡。
来自加州年夜学圣克鲁斯分校的 Beth Shapiro ，曾在 2017 年重组了侯鸽基因组。他暗示，这个研究“超等酷” ，因为它“重现了天然环境下，永远不成能从头呈现的绝迹基因组” 。
来自丹麦天然汗青博物馆的灭尽物种基因组专家 Morten Erik Allentoft 也称这是“重年夜的前进” 。而且，这也是 Revive and Restore 此刻存眷的问题之一——该组织是一个非营利性庇护组织，旨在重现已灭尽物种，如侯鸽、猛犸等。
Revive and Restore 首席科学家本 Novak 认为，这项研究意义不凡，因为此刻我们可以将他们的方式用在‘新生’其他物种了。该组织创始人之一 Stewart Brand 说：“De-extinction （新生灭尽物种）时代逐渐到临。最终，它将被视为另一种形式的物种新生， “像把狼带回黄石公园，并将海狸送回瑞典和苏格兰。 ”

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图丨“新生”灌木恐鸟的手艺道理和“新生”猛犸象的道理不异
那么科学家们是怎么实现的呢？起首，科学家从一个灌木恐鸟标本中收集了耻骨样本，该标本陈列于多伦多皇家安粗略博物馆。
然后，他们再从此中提取 DNA 。然而，这一步并未听起来那么简单。按照来自加州年夜学旧金山分校的 Shapiro ， “DNA 的衰变在灭亡的几天内就起头了。是以，来自标本的 DNA 就像酒杯碎片一样。 ”幸运的是，今天的高通量基因组测序仪可以或许完美地解决这个问题！
高通量基因测序，别名年夜规模平行测序，是将 DNA（或者 cDNA）随机片段化、加接头，制备测序文库，经由过程对文库中数以万计的克隆 (colony) 进行延长反映，检测对应的旌旗灯号，最终获取序列信息。与 Sanger 法为代表的传统测序法比拟，高通量测序手艺在处置年夜规模样品时具有显著的优势，又快（两天）又多（数百万克隆），当作为今朝组学研究的本家儿要手艺。