因为活的益生菌对环境要求非常苛刻，外界温度稍有变化，就会导致大量活菌死亡，而死细菌对肠道没有任何作用 。 即使有益生菌存活，它们也很难通过胃液进入我们的肠道发挥作用，即使通过胃液的考验，最后进入肠道中的量也非常少 。
伦敦大学有研究对市场上的常见益生菌产品进行测试，调查那些产品是否和它们声称的一样含有那么多的微生物、这些细菌是否能够通过胃部的酸性环境以及是否能够到达小肠，结果只有一种产品中的益生菌能在胃酸环境中生存并且能够到达小肠，但细菌的数量却低于其声称的 。
美国微生物学会（AMA）也认为，市场上绝大部分益生菌产品大多是不可靠（unreliable）的 。
而且，益生菌的作用更多的只是一种辅助作用，不能发挥直接的治疗作用，益生菌的研究也是为了配合药物治疗，而不是取代药物 。
2006年，美国微生物学会（American Academy for Microbiology， AAM）发布了一个益生菌的报告，报告指出：迄今为止，绝大多数益生菌在人体中的使用对于疾病处理而言都是预防和支持性的，而不是治疗性的 。
如果肚子疼、便秘，靠喝益生菌饮料还是很难起到立竿见影的治疗效果的，还是不要过度迷信益生菌有药物的强效作用 。
鉴于目前的研究现状，国际上的一些权威机构也认为益生菌改善肠道健康的证据是不充分的 。
如英国国家健康服务体系（NHS）认为，益生菌的健康功效中证据比较充分是可能有益抗生素性肠胃炎，但其他健康宣称均没有足够的证据，如改善应激性结肠综合征、腹泻、疝气等；
同样，欧洲食品安全局（EFSA）评估也认为益生菌改善肠道健康的健康声称是没有足够的证据 。
综合来看，益生菌帮助肠道做运动、改善消化不良的说法其实并没有足够的科学证据，市售绝大数益生菌食品也不能真的帮助我们改善消化不良等肠道问题，只是商家的营销噱头罢了，消费者还是多长个心眼吧 。
参考资料：
1、American Academy for Microbiology. PROBIOTIC MICROBES: THE SCIENTIFIC BASIS, 2006.
2、NHS. Probiotics.
【喝点儿益生菌，就能帮你的肠道“做运动”吗？】3、EFSA delivers advice on further 808 health claims
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