明太祖朱元璋历行“茶马政策” ， 于洪武二十四年（公元１３９１年）下诏“废团茶 ， 兴叶茶” ， 促进了炒青绿茶的发展 。 但云南地处边垂 ， 未经中原统治 ， 并未受其影响 。
至明末清初 ， 西南各省屡遭兵燹战乱 ， 清人挥兵南下平定三藩之乱后 ， 重建统治秩序 ， 恢复和发展原有的农业生产 ， 又一次带来中原先进的制(炒)茶技术 。
公元1644年清朝建立后 ， 云南各地先后收归清政府统治 ， 雍正四年（公元1726年） ， 清政府指派的云南总督鄂尔泰在云南推行“改土归流”政策,雍正七年（公元1729年）设置普洱府治于宁洱 ， 列普洱茶为贡茶 ， 献于皇室 ， 使普洱茶进入了一个历史上的辉煌时期 。
清人倪蜕于《滇云历年志》（卷二）（公元1737年）记载：“雍正七年己酉 ， 总督鄂尔泰奏设总茶店于思茅 ， 以通判司其事 。 六大山产茶 ， 向系商民在彼地坐放收发 ， 各贩於普洱 ， 上纳税课转行 ， 由来久矣 。 至是以商民盘剥生事 ， 议设总茶店 ， 以笼其利权 。 于是通判朱绣上议 ， 将新旧商民悉行驱逐 ， 逗遛复入者俱枷责押回 。 其茶令茶户尽数运至总店 ， 领给价值 ， 私相买卖者罪之 。 稽查严密 ， 民甚难堪 。 又商贩先价后茶 ， 通融得济 ， 官民交易 ， 缓急不通 。 且茶山之于思茅 ， 自数十里至千余里不止 ， 近者且有交收守候之苦 ， 人役使费繁多 ， 轻戥重秤 ， 又所难免 ， 然则百斤之价 ， 得半而止矣 。 若夫远户 ， 经月往来 ， 小货零星无几 ， 加以如前弊孔 ， 能不空手而归?小民生生之计 ， 只有此茶 ， 不以为资 ， 又以为累 。 何况文官责之以贡茶 ， 武官挟之以生息 ， 则截其根 ， 赭其山 ， 是亦事之出于莫可如何者也 。 ”
【普洱茶拼配技艺的出现时期】在雍正七年 ， 云南总督鄂尔泰奏请朝庭 ， 于思茅厅选址设立官办的茶叶总店 ， 指派朱绣任通判之职 ， 亲自掌管总茶店 ， 对普洱茶实行专卖制 ， 六大茶山所产之茶 ， 茶农采制后需全数运交位于思茅的总茶店 ， 待选办贡茶入贡后方分由民间贩卖 。
雍正十二年（公元1734年）的官方文告《禁压买官茶告渝》中有“每年应办贡茶 ， 系动公件银两 ， 发交思茅通判承领办送”的文字 ， 可知当时的普洱茶 ， 虽产于六大茶山 ， 但是集中于思茅集散 ， 贡茶采办亦在思茅 。
清朝以来 ， 普洱茶进入一个历史的极盛期 ， 清·阮福《普洱茶记》（公元1825年)谓之:“普洱茶名遍天下 。 味最酽 ， 京师尤重之 。 ”
这一时期 ， 也是普洱茶花色品种与制作工艺高速发展的时期 ， 清·张泓《滇南新语》（公元1755年)载：“滇茶有数种：生性者曰木邦 ， 曰普洱 。 木邦叶粗味涩 ， 亦作团 ， 冒普茗名 ， 以愚外贩 ， 因其地相近也 ， 而味自虐 。 普茶珍品 ， 则有毛尖、芽茶、女儿之号 。 毛尖即雨前所采者 ， 不作团 ， 味淡香如荷 ， 新色嫩绿可爱；芽茶较毛尖稍壮 ， 采治成团 ， 以二两四两为率 ， 滇人重之；女儿茶亦芽茶之类 ， 取于谷雨后 ， 以一斤至十斤为一团 ， 皆夷女采治 ， 货银以积为奁资 ， 故名 。 制抚例用三者充岁贡 ， 其余粗普叶 ， 皆散卖滇中 。 最粗者熬膏成饼摹印 ， 备馈遗 。 而岁贡中亦有女儿茶膏 。 并进蕊珠茶 ， 茶为禄丰山产 ， 形如甘露子差小 ， 非叶 ， 特茶树之萌茁耳 ， 可却热疾 。 ”
张泓记述的云南茶 ， 不仅有产于六大茶山的普洱茶 ， 还有邻近地区产的木邦茶 ， 木邦茶粗老滋味涩 ， 也做成团茶形式 ， 不法商人用来冒充普洱茶 ， 欺骗外来客商 。
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