以下是利用STAMP时的一些相关问题 ， 具体的STAMP利用教程可以参考我们供给的STAMP利用教程 。
1、 stamp作图用的原始数据的来历？
STAMP 可以直接利用来自QIIME的biom文件和PICUST的KEGG和ko 文件 ， groupfile.txt文件的格局为tab-saperated value (tab键离隔的数据)
2、 分组问题：导入数据之后 ， viewàgroup leg ,在窗口右侧会呈现分组栏 ， 按照需要进行分组 。
3、 Unclassiffied选项中 ， remain Unclassiffied reads、remove Unclassiffied reads、和use only for calculating frequency profiles 方式的区别？
remain Unclassiffied reads和use only for calculating frequency profiles方式会保留所有的数据 ， 而remove Unclassiffied reads仅仅保留有确定分组信息的数据 。
4、 Statistical test 中 ， Welch’s t-test、t-test、white’s non-parametric t-test的区别 ， 各自优错误谬误？
为了确保统计学意义和精确度和切确性 ， 需要足够多的样本数量 ， t-test查验可以在起码样本数为4的时辰确保高的精确度和切确性 。
当两个样本之间具有不异方差的时辰 ， 用t-test更为精确 ， 当两个样本没有不异方差 ， Welch’s t-test更为精确 。
当样本数量少于8的时辰 ， 可以利用white’s non-parametric t-test ， 该计较时候较长 ， 当样本数量过多的时辰不宜利用该方式 。
5、 Two-group 中type: one side 和 two side 的区别？
One side 只会显示前一个group与后一个group差别的比例 ， 而two side 两者之间的比例均会显示 。
6、 STAMP在利用时起首打开了一个阐发文件 ， 若是新打开一个可能会导致显示错误？
今朝版本的STAMP存在一些小问题 ， 一次阐发只能利用一个数据文件 ， 若是要打开新的需要封闭软件后再打开 。
36有其他问题可以联系谷禾信息 。
以上内容就是微生物群落多样性测序与功能分析的内容啦 ， 希望对你有所帮助哦！
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