剧情讲述高中生叶湘伦出身于单亲家庭，跟父亲相依为命 。由于湘伦热爱音乐且琴艺过人，而且他是主修钢琴的音乐系学生，于是转到其父亲任教的淡江中学就读，该校对于培育具音乐才华的学生甚为有名气，特别在弹琴方面 。叶湘伦在转校首天由女同学晴依带领参观校园，二人分别后湘伦走着走着来到琴楼，听到一首极为优美动听的神秘旋律《Secret》；
然后他遇到同样主修音乐且热爱弹琴的同学路小雨，及后上课时湘伦发现小雨竟是自己的同班同学，下课的时候湘伦问及小雨正在弹奏的歌曲时，她轻声的说这是不能说的秘密 。小雨走开了以后，湘伦问及她的名字，然而已她溜走了，在她前方的晴依以为湘伦是在问她，在湘伦后方的老师批评叶湘伦上课不专心（偷看小雨），认为他在泡妞（晴依）而对他训斥一番 。在校门外却遇着下雨，湘伦送小雨回家，二人的情感就此萌芽...
有一天，湘伦在琴楼练习期间，阿郎与阿宝因逃避老师的责罚而冲进琴房并躲进柜中，三人因此而互相认识 。一天，小雨跟湘伦在校园走廊闲谈并享受着阳光的温暖，二人看见叶老师正处分犯错的阿郎与阿宝，让小雨感到惊讶...
一天，小雨睁开眼的时候见到晴依，就跟晴依到学校的礼堂观看湘伦跟绰号“钢琴王子”之称的雨豪斗琴，后来湘伦就胜出比赛... 赛后小雨跟湘伦来到琴楼，二人四手联弹的合奏一曲，却让老师发现... 湘伦跟小雨谈及萧邦与他的情人，湘伦慨叹二人最终也要分道扬镳 。
然而小雨似乎羡慕这对恋人能够在一起10年之久，对这情侣而言，可能是一段很长的时间 。每当湘伦想多了解小雨一点，她常欲言又止，总推说是秘密 。一天的英文课上，老师邀请晴依跟湘伦作示范，课后晴依问及湘伦可否送她回家，但湘伦迟疑的态度让晴依说她只是在说笑 。在后面听到一切的小雨却有点醋意... 下课后，二人来到一家唱片店，
湘伦把他喜欢的歌曲让小雨听，这让小雨感到很开心，她突然亲了湘伦一下就冲出店铺跑回家...二人走到小雨家的天台，小雨感到气喘，需要用药才能平复，小雨嘻笑说不能跟别人亲吻，却单着眼睛看湘伦的反应如何...后来湘伦把斗琴比赛中赢得的《天鹅》乐谱送给小雨，此乐谱小雨已找了好久，二人更轻轻的吻过 。
在学校舞会上，在台上负责钢琴部分的湘伦受到小雨的邀请而到台下跳舞...舞会过后，小雨跟湘伦来到有两台钢琴的房间，小雨教湘伦弹奏《Secret》，而同一时间，晴依在琴楼弹奏著别的乐曲 。在榄球比赛中，湘伦见到晴依手上的手镯很漂亮（大概也想送给小雨），却装作跟晴依聊得很开心，让小雨醋意顿生 。
一天，晴依在某琴房中弹著琴，而学校的清洁工大勇（杜国璋饰）则陶醉地听着，上课时湘伦把便条传给小雨，然而晴依却误会湘伦想跟自己约会 。课后，湘伦在琴房陶醉地闭着眼弹奏钢琴，晴依进去时，湘伦示意吻他，却发现意外地吻了晴依，此时大勇却呼唤小雨的名字，湘伦追出去却已不见影踪，此后小雨再也没有来上课 。
思念著小雨又一头雾水的湘伦决心要找出这个不能说的秘密，及后湘伦到小雨的家里找她，路妈妈说小雨不舒服睡了，也退学了，劝湘伦别再找她 。五个月后，湘伦如常的生活 。到了毕业典礼当天，湘伦到台上表演前，晴依把她的手镯借了给他，好让为他带来幸运 。表演中途，虚弱的小雨突然出现并中途离开，湘伦追了出去....
当他回到礼堂时，表演已经结束 。后来他在学校到处寻找小雨的踪影，阿郎与阿宝在课室当小偷，湘伦问他们有否发现经常跟他在一起那女生的踪影，然而两人却异口同声的说他从来都是一个人，舞会也是，其他的时候亦然，这使湘伦回想这一切发生的事...
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