此后，MUGEN经过了诸多版本的更新完善，民间高手开发的各种新技术、新理念也为玩家们带来了大量优秀的作品 。其中，国人制作者主持制作的KOFZ（企划人：Misamu.K.Young）、KOFW（制作者：凡一）等作品也以出色的平衡性与还原度极高的操作手感获得了国际MUGEN爱好者的广泛关注 。
KOFW与KOFZ曾是中国MUGEN作品中的佼佼者
动荡之中
然而，即便是在MUGEN如日中天的辉煌时期，圈内的风波却从未平息过 。2001年，Elecbyte停止了DOS版MUGEN的更新 。2003年，由mugenchina创建的中国MUGEN权威论坛因为版权等问题被迫关闭，MUGEN爱好者被迫转战至其它论坛分区，这无疑对国内MUGEN作品的传播与发展造成了冲击 。在此期间，Elecbyte似乎经历了一些变动，Elecbyte主页开始出现登录异常、无法连接等情况 。同年11月，Elecbyte关闭了自己的网站，传闻中秘密开发的Win版MUGEN也一直没有正式发布 。
Elecbyte的低调最终变成了沉寂
03年以后，MUGEN界经历了“限制版WinMUGEN泄密、民间破解”等重大事件 。PC操作系统的更迭导致了DOC版MUGEN运行环境的恶化，“官方、民间破解者的矛盾”也为MUGEN的技术发展分散了太多精力 。尽管在民间达人的努力下，泄露版WinMUGEN终于能够正常使用，甚至有人在此基础上开发出了高分辨率的MUGEN版本，但是，风波之后的MUGEN玩家群体却已严重流失 。
2010年，沉默已久的Elecbyte对MUGEN作出了优化更新 。更换了显示引擎后，游戏运行效率得到了质的飞跃，中国国内的MUGEN网站也相继复活 。然而，此时的格斗游戏市场早已今非昔比，各种官方乱斗游戏层出不穷，3D化、新引擎之下的格斗游戏作品也为素材的提取工作带来了不小的技术壁垒 。渐渐的，MUGEN引擎的开发工作陷入了停滞，除了利用现有资源的整合游戏，原创作品少之又少 。曾在国内MUGEN圈雄心勃勃的KOFZ系列也因为MUGEN热度下降、团队成员工作生活等问题不得不以MK3 UP4.1（版本代号）的半成品版本告一段落 。
KOFZ堪称中国MUGEN玩家的有生之年
从玩家到观众
MUGEN玩家越来越少，“MUGEN观众”却为MUGEN维系着仅有的生存空间 。在MUGEN游戏的开发过程中，一部分玩家开始着迷于角色AI的编写，他们聚焦于角色本身，从外部表现的招式、判定再到角色行为内在的反应机制，通过代码编程的方式致力于角色强度的提升 。渐渐的，这些强力AI的精彩对局培养了一批数量可观的“观众群体” 。不知道从什么时候开始，世界范围内各大ACG视频网站接连出现了许多以“XX杯赛”为名的MUGEN AI对战视频，颇有人气 。
“弹幕”是MUGEN杯赛视频的精髓
简而言之，“杯赛”就是把MUGEN人物放在某种特定规则之下进行对战的演出模式 。这些角色通常由AI控制（出于对劳动成果的尊重，录制比赛视频的作者通常会注明AI制作人），对局胜负的战果背后，则是AI制作者编程能力的体现 。当然，“内行看门道，外行看热闹 。”MUGEN观众一般不会过于纠结编程原理，游戏中角色的实战表现才是吸引他们的痛点 。
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