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随着时间慢慢向前推，爱因斯坦的立场也慢慢向现实主义靠近 。他会更加现实地接纳科学理论的内容，将其看作是客观物理现实的偶然而“真实”的表征 。同时，尽管他不想掺和到宗教里，但由于童年时代受犹太教的影响，他对上帝依然抱有一种信赖，这也是他搭建自己哲学理论的基础 。当被问及现实主义立场的时候，爱因斯坦回答说：“‘我还没有找到一个比‘宗教的’（religious）这个词更好的词汇，来表达我们对实在的理性本质的信赖 。”
然而值得注意的是，爱因斯坦相信上帝应该从哲学上来理解，而不是宗教层面 。多年以后，一位纽约犹太教拉比赫伯特·高德斯坦给爱因斯坦打来电报，说愿意付钱请他在50字内回答“你相信上帝吗”这个问题，而爱因斯坦的回复只用了32个字（指英文原文）：“我相信斯宾诺莎的上帝，因所有存在物质之和谐有序显示出了他的存在，但我不相信将自己献身于人类命运及生活的那位上帝 。”巴鲁赫·德·斯宾诺莎与艾萨克·牛顿、戈特弗里德·莱布尼茨处于同一个年代，在他的哲学体系中，“实体”、“自然”与“上帝”是等同的，也正是因此，斯宾诺莎被看作是一个危险的异教徒，甚至被逐出了阿姆斯特丹的犹太教会 。
爱因斯坦不相信人格化的上帝，他眼中的上帝是无限优越，是无形、微妙但没有恶意的，他还是一个坚定的“神定论者” 。在爱因斯坦看来，上帝的“和谐有序”在整个宇宙中都得以体现，在上帝的搭建之下，宇宙完全是由因果定律之结果支配的 。这样一来，爱因斯坦留给自己自由意志哲学的空间就被挤占了：“一切结果都是由先前的某种原因导致的，无论是开端还是结束，一切都被我们所不能控制的力量决定着……远方一个看不见的乐手奏出一支神秘的曲调，人、植物或宇宙尘埃都在和着这一曲调翩翩起舞 。”
狭义和广义相对论给我们提供了一种全新的时空观念以及时间、空间与物质、能量之间的积极互动 。这些理论与爱因斯坦“上帝存在与存在物质之和谐有序之中”的论调完美契合 。然而新生的量子力学理论却反其道而行之，而爱因斯坦本人在1905年该理论创立的时候也出了自己的一份力 。量子力学研究的是在原子和分子层面的物质运动与辐射，颠覆了原本的时空观 。
1926年早些时候，奥地利物理学家埃尔温·薛定谔提出了“波动力学”，以一种相当模糊的方式彻底改变了这一观念 。薛定谔本人则更喜欢以一种更为现实的方式来解释自己的理论，对于“波函数”的描述也一样 。然而在丹麦物理学家尼尔斯·玻尔和德国物理学家沃纳·海森堡的推动下，学界逐渐达成了共识，认为对量子理论的阐释不应该只停留在理论字面层面上 。
从本质上看，玻尔和海森堡认为，当时的科学在描述现实的过程中遇到了概念性问题（conceptual problem），而这个问题正是好几个世纪以来哲学家一直在警示人们的 。玻尔曾经说过：“不存在量子世界，只有抽象的量子力学描述；认为物理学的任务就是要弄清楚自然——这种观点是错误的，物理学关注我们对自然的看法 。”海森堡充分理解量子世界的不确定性，他的观点也呼应了玻尔的实证主义宣言：“我们观察到的不是自然本身，而是自然因我们的提问方式而暴露出的部分 。
”这批物理学家经典的反现实主义“哥本哈根诠释”——否定波函数的实在，认为观测会导致波函数坍缩——很快就成了量子力学的一股主流思潮 。后来一批反对实证主义的物理学家，以戴维·玻姆为例，则提出一种新的机制，认为波函数是人们经验的一种“编码”，而且还包括了我们从这些物理经验中衍生出来的主观信仰和价值，让我们得以在过去的经验中汲取信息，从而展开潜在可能性，对未来进行预测 。
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