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现在有一些预测miRNA靶基因的算法和网站 ， 免费的 ， 例如miRtarget等 ， 网上一搜一大把 。可以用它们去预测 。但这些算法常常不是很靠谱 ， 因此应多几种算法综合考虑 。但这样仍然不是特别靠谱 。实验筛查的方法目前最有效的是转录组+翻译组测序 。其中翻译组测序是中国暨南大学的张弓教授首创的 ， 中国在这个领域上目前还是世界领先的 ， 被作为人类蛋白质组计划的四大支柱之一 。在动物中 ， miRNA的作用原理是不完美匹配mRNA的3'-UTR ， 通过抑制翻译起始来调控基因表达 。据此可以设计 ， 你过表达这个miRNA ， 那么它的靶基因应该是mRNA不怎么变 ， 但翻译中mRNA明显下调 。符合这一特征的即很有可能是miRNA的直接靶点 。再结合软件判断 ， 一般就可以很精准了 。
【如何预测和鉴定miRNA的靶基因】
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