除了正常的孢子生殖外，蕨类的根、根状茎及叶，都能依靠产生的无性芽孢和顶端分生组织产生新植株，所以依据不同类型的蕨类植物应采取不同的繁殖方法 。
分株繁殖是蕨类无性繁殖最常用也是最有效的方式 。这种方法主要适用于有横走茎或丛生的种类 。分株过程很简单，将蕨挖出后用利器分成两个或多个独立的植株，每个小植株至少要有1个芽，并给母株留有足够生长的根状茎就行了 。姬蕨的地下茎蔓延很快，可在早春到夏初出现新芽时将其分株 。骨碎补科植物，根总是暴露在营养土表面，只需切取带有足够根系和新芽的部分，适度剪去老叶，栽于腐殖土中，很快就能长出新根和新叶 。有气生根的蕨如槲蕨，多成丛地附生在树干或岩石上，根状茎肥厚，能贮存水分，分株时要保证有足够的根 。对于丛生性或直立根茎的蕨如鳞毛蕨、蹄盖蕨等，可用利刃一分为二，分别栽植 。一些特殊的蕨如鹿角蕨，会在根上或根状茎上长出小植株，可待其长出保护叶后，用刀在其最老的保护叶上切下小植株并带部分基部蕨叶，用铁丝固定在蛇木板或腐烂的木板上，保持高的湿度使其恢复生长 。分株后的植株都需要精心养护，以利于长出新根 。需将每个部分剪掉过大的根系及枯叶、叶柄及受伤部位后，栽于排水良好的基质上，并适度遮荫，保持温湿度，特别要保护好新的拳芽和未展开的小叶，在细心养护下很快就能恢复生长 。
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有些蕨有在叶子上产生小植株的能力，这种小植株称为珠芽 。在叶子顶端着生珠芽的种类有长生铁角蕨、单芽狗脊蕨及其过山蕨等 。过山蕨每株植物会有2~3个成熟的珠芽，如弓状弹落到地面便形成小植株，小植株长大后又能长出小珠芽，不断地繁衍就能越过小山梁，因此得名过山蕨 。在叶脉上散生小植株的种类有多鳞耳蕨，可分段切下带小植株的叶脉，植入沙和腐殖土(3：1)混合的土壤 。胎生狗脊蕨和芽孢铁角蕨等在叶面上着生珠芽 。连在母体上的珠芽可以从母本植株获得充分的水分和养料，通常待其长到一定大小时，最好是生根后，才从母体分离下来 。此时繁殖成活率高，可栽于沙和泥炭土混和的基质中，不要埋得过深，盆上覆盖玻璃板或塑料薄膜，以保持空气湿度 。也有人借助于一个铁丝圈将母体的珠芽部分固定在土面上，使之自然长成小植株，最后再与母体分开，成为独立的小植株 。
与珠芽非常相似的是芽孢，这也是一种叶上的无性繁殖芽，是松叶蕨属和附生的石松等蕨类所特有的 。在配子体发育过程中产生一群小芽孢，当它们成熟后，就会随着雨水扩散，着生于树皮上或土壤中 。
许多蕨类能在侧枝上生长出类似根的匍匐茎，大多数的匍匐茎是地生的，肾蕨属植物的匍匐茎是气生的，往往悬于空中，只有落到地面接触土壤时，才能长成小植株 。匍匐茎会从母体向四周延伸，这时如再用土壤压盖，就会产生新的芽和根 。刚长出的小植株需继续从母株上吸取水分和营养，所以不能急于将它与母株分离，要待其能够自养独立生存时，才能在接近母株的地方切断匍匐茎，将小植株移到新的培养条件下 。通常在春夏间移植成活率最高 。
压条对一些特殊的蕨是很好的方式 。如对穗状的石松及攀缘的蕨如海金沙等，将其生长部分用混合土压盖，芽眼处就会生根，待生长良好后分离即可 。骨碎补科的一些种类地上部分有长的根状茎，可用空中压条方法 。将湿润的腐殖土和苔藓用塑料薄膜包扎在茎干上，2~3个月后可以看到根开始生成，当根系布满后，从主茎上剪下移植，就成为新植株了 。对开蕨类植物也可采用压条法繁殖，将靠近根茎的成熟的老叶子摘下，去掉死亡物质，置于消毒过的沙和泥炭土(3：1)的混合土壤中，栽植槽上面覆盖玻璃或薄膜，在温暖而遮荫的条件下，1~2个月就会出现新芽，待其长出良好的根和叶时就可移于盆中 。这种近似扦插的方式很有实用价值 。
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