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新冠肺炎始发于肺部，它和流感有很多相似的地方 。感染以后病人可能出现咳嗽、打喷嚏、发烧等症状，最后发展成肺炎 。有三个阶段，第一阶段是病毒复制期，第二阶段是免疫系统过度反应的肺损伤，第三阶段就是修复 。
首先，肺是感染新冠肺炎的原爆点，这种疾病通常会在三个阶段攻击肺部：病毒复制期、免疫系统过度反应期和肺损伤期 。感染初期，新冠病毒会迅速入侵人体肺细胞 。出现双肺肺炎，并伴有呼吸急促等症状 。接着，进入第二阶段，免疫系统展开工作 。病毒入侵后，我们的身体会开始战斗，向肺部输入免疫细胞，清除损伤，修复肺部组织 。正常情况下，发炎过程会受到严格控制，并且仅限于被感染的区域 。但有时免疫系统会失控，免疫细胞杀死所有的东西，包括健康组织 。在第三阶段，肺损伤将持续下去，最终导致呼吸衰竭 。即使没有死亡，一些病人也会罹患永久性的肺损伤 。
其次，“细胞因子风暴”，细胞因子如TNF-α、IL-1等是指免疫系统用来发出警报的蛋白质，它们负责把免疫系统集中到感染部位 。接着，免疫细胞杀死被感染的组织，拯救身体其他部分 。免疫系统的日常工作是清除感染，当人体遇到威胁时依靠免疫系统保护自己 。“细胞因子风暴” （cytokine storm）是指是指机体感染微生物后引起体液中多种细胞因子迅速大量产生的现象，如果免疫系统被激活到极限程度或者失去控制，它就会伤害宿主，极端的免疫攻击，引起肺部严重损伤，导致急性呼吸衰竭和多脏器衰竭 。除了肺部病变特征以外，出现了至少一种其他症状：肝酶升高，白细胞和血小板数量减少，血压降低、急性肾损伤、心肌损害、心脏骤停，即免疫系统不仅攻击被感染的细胞，连健康组织也不放过 。
【新冠肺炎会对人体造成哪些损害】最后是多器官功能损害，产生细胞因子风暴后，由于引发的炎症导致的细胞因子风暴会进入循环系统，引发多个器官的系统性问题，出现肾功能衰竭、心肌损害、心力衰竭、肝功能损害、凝血功能障碍 。
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